Faculdade de Direito da Universidade de Coimbra
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Desde que foi criado, em 1991, até se ter constituído como associação, em 30 de Setembro de 1996, o IJC foi dirigido pelo Responsável Científico, Prof. Doutor A. Pinto Monteiro, e pelo Conselho de Gestão, que além do Responsável Científico incluía o Presidente do Conselho Directivo da Faculdade (inicialmente, o Prof. Doutor Orlando de Carvalho, depois o Prof. Doutor Avelãs Nunes), o Presidente do Conselho Científico da Faculdade (inicialmente, o Prof. Doutor Rogério Soares, depois o Prof. Doutor Orlando de Carvalho) e o representante do Patrocinador Principal (a Portugal Telecom, através do Dr. César Comes).
Os patrocinadores do IJC forma(va)m uma Assembleia de Patrocinadores que dá parecer sobre o plano de actividades e gestão do Instituto.

Com a constituição da Associação, o IJC dispõe actualmente dos seguintes órgãos:
Assembleia Geral
Mesa da Assembleia Geral
Presidente da Mesa – Professor Doutor Rogério Soares;
Vice-presidente – Professor Doutor Faria Costa;
Vogal – Prof. Doutor Paulo Mota Pinto
Direcção
Presidente – Professor Doutor Pinto Monteiro;
Vogal – Prof. Doutor Pedro Gonçalves;
Vogal – Dr. César Gomes da PT, Portugal Telecom, SGPS, S.AA Direcção do IJC, na sua primeira reunião de 13 de Novembro de 1996, elegeu o Prof. Doutor Pinto Monteiro como Presidente.
Conselho Fiscal
Presidente – Professor Doutor Vieira de Andrade;
Vogal – Professor Doutor Jónatas Machado;
Vogal – Dr. Marques de Carvalho
Assembleia de Patrocinadores
Presidente – Dra. Isabel Rodrigues Areia, em representação do ICP – ANACOM, Autoridade Nacional de Comunicações